El Siglo XVI fue sin duda de gran prosperidad para Cenicero pues a mediados se empieza la construcción de la iglesia , probablemente en el mismo solar en que se encontraba la antigua de San Martín ya citada en la carta de compromiso. También durante aquellos años, en 1557 exactamente, se contruye el crucero y se inician las obras de la ermita de la Virgen del Valle. Durante estos años también se construyó la ermita de San Cristóbal.

Ya en 1.553 hay noticias del Hospital, encontrándose al lado del camino de Valdemontán y se pasó a la calle de "El Molino".En 1696 se puso un cristo sobre la puerta, el cual se alumbraba el Jueves y Viernes Santo.

Felipe IV, en el año 1.636 y en agradecimiento al ofrecimiento que le hace el Concejo del lugar de Cenicero de servirle siete mil maravedíes por cada uno de los vecinos:"Eximo saco y libro a vos el dicho lugar de Çeniceros de la jurisdición de la dicha ciudad de Naxara y os hago Villa".No sólo nombró villa a Cenicero, sino que once años más tarde, en 1647 y debido a estar muy pobre de tierras la villa, le pidieron al "merced de poder arar y sembrar hasta 8.000 fanegas en los términos de la Rad y la Verde, en las partes más cercanas a la villa y más a propósito para ello" ; se le ofrecieron por la merced cuarenta mil ducados. El ofrecimiento fue aceptado, posteriormente y debido a las reclamaciones de Huércanos y Uruñuela, éstos pueblos tomaron tal como se convino, 2.200 fanegas quedándose Cenicero 5.780 fanegas.